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水生生态系统是一个维持水质,病原,水生生物之间平衡关系的极为复杂的系统。在探讨水产动物病害发生的原因,对水环境微生物的研究(特别是细菌)时,往往都认为是有害的,微生物生态学和微生态的研究表明水环境和水生生物中存在大量的有益微生物,这些微生物直接影响水质和水产养殖。其实微生物无论从群体还是从个体说,它都是具有两重性,既有致病作用,也有生理作用,致病作用和生理作用是相对的,只有在特殊状态下,才会表现致病作用。